一般情况下稳转株指的是多克隆细胞系，多克隆细胞系是多个阳性细胞克隆的混合细胞群，每个细胞其外源片段的整合位点不一样，在长期培养过程中容易出现表型不稳定的现象。单克隆细胞株是由单个细胞分裂扩增形成的单一细胞群，可以长期稳定表型。大部分情况下，多克隆细胞系足以保证实验完成，而对于基因表达效率低、细胞难转染等情况以及药物靶点筛选等要求较高的实验，则更建议进行单克隆细胞筛选。