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最后活动于 11 天前

我想通过荧光共振能量转移技术(FRET)验证两个蛋白的互作关系,这两种荧光该怎么选择?

我转染了带荧光标记的siRNA,为什么对照组和实验组的siRNA在荧光显微镜下都看不到光?

我想过表达SELENOP这个基因,但是为什么从NCBI下载的CDS序列中间有很多终止密码子,这还能正常表达这个蛋白吗?

我有一个验证过的有编辑效率的gRNA,之前一直在细胞上做实验的,效果很好,现在想把这个gRNA包成AAV,注射Cas9基因小鼠可以吗?

+  -的话,其实就是多克隆位点的顺序,可以结合质粒图谱看下,-的只不过是把+的多克隆位点反过来了~

不用和其它细胞分开培养箱放的;感染操作在安全柜进行即可,操作完后酒精喷下操作台擦拭干净即可。

可以的,不过需要注意的是:染目的基因抗体的话,这个基因内源外源都表达,看不出来转染效率的;但是如果带标签的话可以染标签抗体,只看外源的,不过对照组就染不出来了因为对照组没有标签蛋白的表达。

可以离心的,病毒液在冰上或者4℃化冻后,可以离心甩一下(离心不用太高速,就是低速甩下就好),然后用枪轻轻吹匀即可。

为什么做质粒转染的时候建议用无血清、无双抗的培养基?

我想在你们这做一个基因敲除单克隆株,但是敲除之后细胞会不会不生长啊?

我在构建质粒的时候看到有的同学把荧光和目的基因融合表达了,这么做有什么目的吗,我也需要这么构建吗?

我想过表达一个基因,但是为什么NCBI上显示有好多isoform,还有很多transcript variant,这些是什么意思?我应该选哪个做实验呢?

先放在4℃就可以啦,质粒是DNA,比较稳定的,要避免反复冻融。使用完之后可以放回-20℃,如果一管中质粒量很多,也可以再次分装之后于-20℃冻存。

使用嘌呤霉素成功筛选好稳转株后,后续培养仍需要加嘌呤霉素给予细胞选择压力来维持培养(嘌呤霉素浓度可以减半),或者也可以每隔一代加一次嘌呤霉素。

液体LB培养基中氨苄或卡那的常用工作浓度是50ug/ml。氨苄青霉素母液浓度一般配制为100mg/mL,卡那霉素母液浓度一般配制为50mg/mL。

MOI(Multiplicity of Infection,感染复数)是指每个细胞感染的病毒数,通常MOI越高,慢病毒整合到染色体的数量以及目的蛋白的表达量越高。
那么我们在对细胞进行慢病毒感染时,其所需要的病毒母液体积计算公式如下:
每孔加病毒量(uL)=[(MOI x 细胞数)/病毒滴度(TU/mL)] x 1000
也可以直接利用汉恒生物的病毒体积计算器计算更方便:关注“汉恒生物”公众号,下方“资源中心”-“病毒体积计算器”即可使用,或使用网址---https://support.hanbio.ne

为什么在RNA的提取时。RNA总量会很低?

为什么制SDS-PAGE胶的时候总是漏胶?

Co-IP之后的Wb结果中,50kDa和25kDa那里总是有杂带怎么办?

悬浮细胞怎么提高病毒感染效率?

AAV的包装容量(两个ITR之间的片段大小)通常不能超过4.5Kb,除掉启动子、EGFP标记、转录终止信号polyA等元件之外,外源基因的容量能力一般在2kb以下。

腺病毒对细胞的感染效率受多个因素影响,如病毒活性、细胞自身的状态、MOI值、感染时
间等。
 ① 病毒活性:解冻病毒一定要在冰上进行,尽量避免反复冻融;-80℃保存半年以上需要重新测滴度。
 ② 目的细胞:先进行预实验测试,看病毒载体是否合适感染目的细胞;对于悬浮细胞,可采用平角离心感染的方法;也可以减少病毒感染时的体积,从而提升感染的效率。
 ③ MOI值:进行MOI梯度摸索实验,找出最优的MOI浓度。
 ④ 感染时间,腺病毒一般在感染后8-16h换液,太早换液会导致

引物别设计在突变位点处,或者qpcr产物范围避开同义突变位点,一般对于qpcr检测没什么太大影响的。

circRNA是非编码蛋白,不产生蛋白质,不需要加蛋白标签(如flag,HA,His等),蛋白标签是蛋白层面的,而非编码RNA不翻译表达蛋白;当然如果是研究circRNA编码翻译功能的话,一般是会加蛋白标签便于后续检测。

我想干扰敲低一个miRNA,有什么方法吗?

转染siRNA之后没有干扰效率是怎么回事?

我把siRNA的浓度加大了为什么敲低效率反而降低了?

我觉得可能有以下几个原因:
①有些蛋白半衰期长,即使干扰也不一定能被很块降低;②部分蛋白在胞内的翻译有一定效率,干扰降低mRNA,细胞可能进一步提高翻译的效率,导致蛋白受的的影响没有mRNA那么直接;③蛋白在胞内有一定的代谢率,且是可变的,当表达减少,胞内蛋白降解效率也可能反向调节。

siRNA和shRNA在结构上是不一样的,siRNA是化学合成的,分子较小,转染效率可以的情况下,进入细胞的分子量特别多,且不需要经过剪切加工就可以和靶点结合,干扰效率高。
shRNA是将干扰片段克隆到DNA上,经过病毒整合(慢病毒)或非整合(腺病毒,腺相关病毒)进入到细胞后,转录形成发夹RNA,再经过一系列酶的剪切加工,才形成可以和靶点结合的干扰RNA。
这个过程中因为拷贝数低(如慢病毒需要整合基因组),转录加工过程复杂,会导致干扰效果可能不如siRNA理想。


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