Cre-loxp系统是一种基因编辑技术，它包含两个重要成员：Cre重组酶和LoxP序列。Cre重组酶来源于大肠杆菌P1噬菌体，由343个氨基酸组成，能够特异性识别LoxP位点，从而重组LoxP位点间的DNA片段。LoxP位点长34 bp，其特征结构为回文结构，是Cre重组酶的识别序列；核心结构为重组发生序列，也决定了LoxP位点的方向。

Cre重组酶介导两个LoxP位点间的重组是一个动态、可逆的过程，可以分成四种情况：1）如果两个LoxP位点位于一条DNA链上，且方向相同，Cre重组酶能有效切除两个LoxP位点间的序列；2）如果两个LoxP位点位于一条DNA链上，但方向相反，Cre重组酶能导致两个LoxP位点间的序列倒位；3）如果两个LoxP位点分别位于两条不同的DNA链或染色体上，Cre酶能介导两条DNA链的交换或染色体易位。4）如果四个loxP位点分别位于两条DNA链或染色体上，Cre重组酶诱导loxP间的序列互换。