请问下能不能做转录因子结合miRNA启动子的双荧光素酶验证?
请问下能不能做转录因子结合miRNA启动子的双荧光素酶验证?
By 梧桐树下
at 2024-05-24
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1 个回复 | 最后更新于 2024-05-27
可以做的,但是miRNA的启动子不好确定。目前NCBI或USCS中提供的都是pre-miRNA的序列,并不是初级转录本pri-miRNA的序列,因此想要找到miRNA的启动子区首先需要确定pri-miRNA,遗憾的是目前似乎还没有专门收录pri-miRNA的数据库。那么,想要获取pri-miRNA序列可以通过RACE实验确认;此外,有一个数据库—TransmiR v2.0可专门用于预测转录因子和miRNA启动子互作,并给出可能结合的启动子区。