AAV应用时效果不理想的有关影响因素很多，从病毒本身到检测目的基因表达这些过程都有涉及，具体可以从以下几个方面来分析：

（1）病毒本身：①病毒滴度是否符合实验要求；②插入的外源基因是否正确；③外源基因的长度是否在AAV的载体容量范围内，过大会导致出毒失败或滴度较低；④病毒运输和保存条件是否合适，应尽可能避免反复冻融，运输最好置于干冰中；⑤不同AAV血清型对不同组织的感染效率有差异，是否选择了合适的血清型；⑥AAV启动子的是否为强启动子或组织/细胞特异性启动子。

（2）注射方式及用量：针对不同组织的感染，选择正确的注射方式及注射量能够有效提高AAV的感染效率。

（3）实验动物及操作：实验动物的选择是否合适、注射AAV前实验动物的生长状态是否正常、实验人员的操作手法是否娴熟，这些也是影响实验结果的重要因素。

（4）检测方面：①AAV在体内表达的时间需要2周左右，达到表达高峰需要3-4周，选择这个时间段检测表达比较合适，一般可以维持表达3-6个月，若需要持续高表达可以适当得间隔1-2个月补打一次；②样本提取方法及操作是否得当，可采用多种方法进行检测。