因为前面的几十个碱基是无法识别的杂峰，最后几百个碱基也是无法识别的杂峰，我们无法知道这部分序列的真实数据。将目的片段放到载体上，使用载体引物（距插入基因100bp左右）测序，可获得完整准确的基因序列。此外，PCR产物易降解，而质粒稳定也是通常选择TA克隆测序的原因之一。