我做敲低,siRNA下调效果很好,但是包装成shRNA病毒后,下调效果变差了,这是为什么呢?
我做敲低,siRNA下调效果很好,但是包装成shRNA病毒后,下调效果变差了,这是为什么呢?
By 橘子
at 2023-12-04
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我做敲低,siRNA下调效果很好,但是包装成shRNA病毒后,下调效果变差了,这是为什么呢?
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1 个回复 | 最后更新于 2023-12-06
siRNA和shRNA在结构上是不一样的,siRNA是化学合成的,分子较小,转染效率可以的情况下,进入细胞的分子量特别多,且不需要经过剪切加工就可以和靶点结合,干扰效率高。
shRNA是将干扰片段克隆到DNA上,经过病毒整合(慢病毒)或非整合(腺病毒,腺相关病毒)进入到细胞后,转录形成发夹RNA,再经过一系列酶的剪切加工,才形成可以和靶点结合的干扰RNA。
这个过程中因为拷贝数低(如慢病毒需要整合基因组),转录加工过程复杂,会导致干扰效果可能不如siRNA理想。