针对一个LncRNA设计了几条siRNA做RNAi,但效果都不是很好,可能原因有哪些?

针对一个LncRNA设计了几条siRNA做RNAi,但效果都不是很好,可能原因有哪些?

By 下一班 at 2023-09-15
0人收藏 • 325人看过


1 个回复 | 最后更新于 2023-09-15
落落
2023-09-15
#1

1)LncRNA大部分是定位于细胞核内, RNAi 机制在细胞质效率远高于细胞核,所以实验前最好弄清楚LncRNA的定位,如果定位于核内就不建议选择siRNA,可以考虑设计ASO进行干扰;

2)LncRNA 是具有高度二级结构的RNA,可能影响siRNA 与 lncRNA 的结合;
3)LncRNA 与 DNA 及蛋白形成复合体,同样阻碍 RISC 复合体与 lncRNA 的结合效率;
4)LncRNA 在多种类型细胞或模型中表达丰度低,可能会影响干扰效果的判定。


登 录