融合表达后目的序列+荧光标记表达一个蛋白，荧光蛋白可以指示目的蛋白在细胞中的表达位置；非融合表达目的蛋白和荧光蛋白分开表达或表达后断裂成两个蛋白，最终是两个独立的蛋白。