GFP慢病毒感染细胞后，荧光强度取决于病毒进入到细胞的颗粒数、细胞本身的增殖状态、细胞类型、观察时间、GFP前的启动子活性等因素。

GFP基因荧光表达的强度与启动子的活性、目的细胞感染的病毒颗粒数呈正相关。慢病毒在增殖较快的细胞中感染48~72ｈ（腺病毒则是36~48h），GFP蛋白表达才达到峰值；在增殖较慢的细胞中，GFP蛋白表达到达峰值需更久。GFP基因接在强启动子后面时荧光表达较强，弱启动子则荧光表达较弱。

观察荧光时最好关掉室内灯光，只留荧光显微镜光源。