血清一度曾被认为会降低转染效率，在开始准备DNA和阳离子脂质体试剂稀释液时要使用无血清的培养基。血清中含有大量的蛋白质，在转染过程中，带负电的蛋白质可能干扰阳离子脂质体/阳离子聚合物对核酸的吸附，影响转染效率。但在复合物形成后，在加入细胞中前可以加入血清。当然，最好是按照转染试剂说明书的要求来进行操作。

双抗一般对于真核细胞无毒，但阳离子脂质体试剂增加了细胞的通透性，使双抗可以进入细胞。这降低了细胞的活性，导致转染效率低。所以，在转染培养基中不能使用双抗，甚至在准备转染前进行细胞铺板时也要避免使用双抗。