答：蛋白本身可能受多因素调控，RNAi是针对转录水平的调控，到蛋白多一步翻译，某些情况下不能保证mRNA完全与蛋白水平一致。
（1）该蛋白的半衰期比较长，导致在检测时，之前表达的蛋白还未降解，确定半衰期需要用测定半衰期的方法检测，具体是用一些蛋白合成抑制剂处理后，隔一定时间检测该蛋白的水平；这种情况可以建议客户多隔一段时间再检测；
（2）该蛋白有多种转录本，可能有不同isoform的蛋白，要确定下是不是这条siRNA是针对所有的转录本；
（3）另外最后的可能就是该基因的翻译效率较高，较少mRNA仍能维持较高的蛋白水平。