自噬体和溶酶体结合形成自噬溶酶体是完成自噬的最后一步，处于膜上的LC3-Ⅱ会被Atg4切割，产生LC3-Ⅰ循环利用，处于自噬溶酶体膜内的LC3-Ⅱ会被水解酶水解掉。