因为AAV是单链DNA，感染细胞后需要先变为双链才能进行转录翻译，因此存在表达延迟的可能。另外，细胞在体外生长速度较体内快，AAV感染细胞后随着细胞的快速分裂不断稀释，进一步导致了表达水平降低。而在体内实验中，AAV感染的组织细胞增殖速度通常不会那么快，且AAV不同血清型和启动子配合使用，更适合用于体内实验。