由于AAV的基因组是单链DNA，进入细胞后需经过由单链变成双链的过程才能开始转录翻译。体外培养的细胞体系中如果没有辅助病毒或者辅助因子的情况下，这种DNA单链转变成DNA双链的过程非常缓慢，所以目的基因表达滞后。而AAV注射进动物体内之后，靶器官组织里的各种辅助因子相对丰富，有助于AAV在体内快速表达，表达水平和持续时间更加稳定。