一般是以下原因：（ 1） 常规原因， 包括病毒滴度、 细胞感染难易程度等（ 2） 目的基因大小， GFP 蛋白水平的表达会受到目的基因的大小而变化， 通常接入的基因越大， GFP 荧光越弱（ 3） 目的基因的功能的影响 GFP 的表达。 对于核定位、 膜定位、 分泌类的蛋白与 GFP融合表达， GFP 观察荧光时会受到目的蛋白的功能的影响； 通常在同等基因大小条件下， 无定位趋势的目的基因和GFP 融合蛋白的荧光强度要远高与具有定位趋势的基因的表达。