Spcas9、Sacas9 有什么区别? dcas9又是什么?
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小脑斧123
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Spcas9与Sacas9的主要区别在于它们的来源、基因序列长度、识别的PAM序列以及应用特性。
来源与大小:Spcas9来源于化脓性链球菌,基因序列长约4.1kb,分子量较大;而Sacas9来源于某种球菌,基因序列长约3.3kb,分子量较小。
PAM序列:Spcas9识别的PAM序列为5’-NGG-3’,而Sacas9识别的PAM序列为5’-NNGRRT-3’。Sacas9的PAM序列更长,在基因组中出现的概率更低,因此脱靶率较低,但gRNA设计相对困难。
应用特性:由于Sacas9的基因序列较短,它更容易被包装进载体中,特别是对于包装容量有限的病毒载体如AAV。而Spcas9虽然使用更广泛,但其较大的大小可能限制了一些递送系统的使用。
至于dcas9,它通常是指Cas9的突变体或变体,用于基因调控而非切割,如通过融合抑制域来构建CRISPRi系统,实现基因表达的抑制。