用siRNA做基因干扰，为什么要强调mRNA水平检测？可以直接检测蛋白和功能吗？

siRNA直接作用于mRNA，因此mRNA水平检测是最直接的指标。很多人认为，mRNA降解的直接结果应该是对应蛋白质含量的下降，因此蛋白水平的检测结果也应该可以作为有效性的检测指标。事实上，很多情况下会出现，mRNA下降水平与蛋白下降水平不对应的现象。其可能原因有：1.与选择的检测时间有关，因mRNA的下降尚未反映在蛋白量的变化上或者未达到足以检测的水平，所以一般建议蛋白和功能检测时间要稍稍推后；2.与蛋白在细胞中的表达情况有关，mRNA的翻译过程非常复杂，细胞内基因的表达总要维持一个平衡，某些蛋白表达量到一定的程度之后，足以维持其细胞功能，将可能暂时“关闭”表达的功能，转录出来的部分mRNA可能不参与蛋白翻译的过程，因此，mRNA水平的下调与蛋白水平下调并非完全成正相关的关系；3.可能还会涉及到更加复杂的转录翻译调控机制。