请问下能不能做转录因子结合miRNA启动子的双荧光素酶验证？

可以做的，但是miRNA的启动子不好确定。目前NCBI或USCS中提供的都是pre-miRNA的序列，并不是初级转录本pri-miRNA的序列，因此想要找到miRNA的启动子区首先需要确定pri-miRNA，遗憾的是目前似乎还没有专门收录pri-miRNA的数据库。那么，想要获取pri-miRNA序列可以通过RACE实验确认；此外，有一个数据库—TransmiR v2.0可专门用于预测转录因子和miRNA启动子互作，并给出可能结合的启动子区。