用自噬双标病毒感染细胞观察自噬时，最终的结果应该怎么统计，是统计绿光和红光的细胞个数吗？

不是的。建议使用激光共聚焦显微镜来观察，将绿光和红光的细胞图像merge后，统计单个细胞内的红色荧光点数和黄色荧光点数，然后计算它们的比值即可反映自噬流的情况。EGFP是酸性敏感的荧光蛋白，在溶酶体的酸性环境中会淬灭，因此红色荧光代表自噬溶酶体，黄色荧光代表自噬小体。另外，有些文章统计的是绿色荧光点和红色荧光点的变化，这样也能反映自噬的变化，但由于自噬小体和自噬溶酶体都能显示红光，因此不能具体分辨出自噬流的变化。