不同物种之间的circRNA同源性该怎么确定？研究人的circ，想再在小鼠研究一下同源的circ。
不同物种之间的circRNA同源性该怎么确定？研究人的circ，想再在小鼠研究一下同源的circ。
By MR. 司
at 2020-05-27
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不同物种之间的circRNA同源性该怎么确定？研究人的circ，想再在小鼠研究一下同源的circ。
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2 个回复 | 最后更新于 2020-05-27
MR. 司
2020-05-28
#1
可以用circ的序列到NCBI上做一个blast试试，看能否找到小鼠的同源性比较好的circ。
汉恒-杨燕
2020-05-28
#2
cirRNA的同源性在人、大鼠、小鼠之间是很差的，这可能是与当前cirRNA还有很多未发现的原因相关，这个同源的cirRNA一般是要借助cirbase里面cirRNA对应的基因，然后去比对同源性